A resposta curta é: Sim, você pode navegar em sites HTTPS normais usando o Tor.
As conexões HTTPS são usadas para proteger as comunicações através de redes de computadores.
Você pode ler mais sobre HTTPS aqui.
O modo somente HTTPS do navegador Tor alterna automaticamente milhares de sites de "HTTP" não criptografado para mais "HTTPS" privado.